Белгородская городская дезинфекционная станция организована решением исполкома городского совета от 20 декабря 1978 г. № 780, а с 11 февраля 1998 г. Белгородская городская дезинфекционная станция переименована в государственное учреждение «Дезинфекционная станция в г. Белгороде» (приказ о переименовании № 5 от 02.02.1998 г. Центра Государственного санитарно — эпидемиологического надзора в Белгородской области).
На основании Распоряжения Правительства Российской Федерации от 17 января 2005 г. № 32-р «Об утверждении перечня подведомственных Роспотребнадзору Федеральных государственных учреждений», приказа Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека № 205 от 28.02.2005 г. «Об утверждении Устава» государственное учреждение «Дезинфекционная станция в г. Белгороде» с 01 ноября 2005 года переименовано в Федеральное государственное учреждение здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгороде, г. Белгород» (приказ по учреждению № 100 от 31.10.2005 г.).
С 01 июля 2011 года Федеральное государственное учреждение здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгороде, г. Белгород» переименовано в Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгороде, г. Белгород» (приказ по учреждению №23 от 30.06.2011 г.) на основании приказов ФС Роспотребнадзора от 01 февраля 2011 г. № 27 «Об утверждении Перечня подведомственных Роспотребнадзору федеральных бюджетных и казенных учреждений здравоохранения и науки» и от 11.05.2011 г. № 450 «Об утверждении Устава».
С 13 ноября 2012 года Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгороде, г. Белгород» переименовано в Областное государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгород» на основании распоряжения Правительства Российской Федерации от 05 мая 2012 года № 751-р «О передаче субъектам Российской Федерации федеральных бюджетных учреждений здравоохранения, подведомственных Роспотребнадзору» и распоряжения Правительства Белгородской области от 25 июня 2012 г. № 338-рп «О приеме в государственную собственность Белгородской области Федерального бюджетного учреждения здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгороде, г. Белгород»», приказа Департамента здравоохранения и социального развития Белгородской области от 12.09.2012 г. № 2174 «Об утверждении Устава Областного государственного бюджетного учреждения здравоохранения «Дезинфекционная станция в г. Белгород».